Ο Θάνος Μαρούκης είναι κοινωνιολόγος. Αποφοίτησε το 2001 από το Τμήμα Κοινωνιολογίας του Παντείου Πανεπιστημίου Κοινωνικών και Πολιτικών Επιστημών στην Αθήνα. Συνέχισε κάνοντας μεταπτυχιακές σπουδές στο Τμήμα Κοινωνιολογίας του Πανεπιστημίου του Bristol (Ηνωμένο Βασίλειο) (2002) εστιάζοντας ιδιαίτερα σε ζητήματα εθνικότητας και πολυπολιτισμικότητας. Το 2007 ανακυρήχθηκε Διδάκτωρ του Τμήματος Οικονομικής και Περιφερειακής Ανάπτυξης του Παντείου Πανεπιστημίου. Η διατριβή του εξετάζει τις επιπτώσεις της μετανάστευσης στην ελληνική οικονομία. Κύρια ερευνητικά του ενδιαφέροντα αποτελούν η μετανάστευση, η μεταναστευτική πολιτική και η αγορά εργασίας. Εργάζεται ως ερευνητής στο Ελληνικό Ίδρυμα για την Ευρωπαϊκή και Εξωτερική Πολιτική (ΕΛΙΑΜΕΠ). Οι θεματικές με τις οποίες έχει ασχοληθεί σε αυτό το πλαίσιο αφορούν την οικονομική μετανάστευση από τα Βαλκάνια προς χώρες της Ευρωπαϊκής Ένωσης και την ανεπίσημη μετανάστευση.